El objetivo de la línea de investigación es administrar los recursos hídricos de las cuencas con la finalidad de poder conseguir una mejor distribución de dicho recurso entre los diferentes usuarios, manteniendo un equilibrio entre lo técnico, económico y ambiental. Los tipos de trabajos e investigaciones desarrollados en esta área se han centrado en la determinación de la distribución óptima del agua, tanto para la gestión presente como futura de una cuenca, donde pueden intervenir diversos factores como el cambio climático. Se han realizado estudios de valoración de los problemas de escasez de agua, evaluación de regiones de inundación para la determinación de acciones de gestión, entre otros.