La presente invención se ubica en el campo técnico del procesamiento agroindustrial del tarwi u otros granos. En concreto se refiere a un sistema semicontinuo para el desamargado de tarwi y otros granos que comprende: al menos un tanque principal (I), al menos dos tanques de lavado (II), y al menos un contenedor de recepción (III), donde dichos tanques están conectados hidráulicamente. Adicionalmente, comprende un módulo de control conectado electromecánicamente a todo el sistema. El sistema semicontinuo para el desamargado de tarwi y otros granos supone una mejora en el estado de la técnica ya que la diferencia estructural proporciona una mayor capacidad de producción con el sistema semicontinuo, conservación de la calidad del grano, retención de compuestos nutricionales, y un sistema amigable con el ambiente ya que las aguas utilizadas en el proceso son recirculadas.