Project name
Sistema descentralizado de vigilancia genómica para evaluar transmisión y evolución de SARSCoV-2 en Perú
Acronym
046-2020-FONDECYT
Project code
046-2020-FONDECYT
Status
Finished
Web site
http://proyectoscti.concytec.gob.pe/index.php/buscador/ficha_proyecto/2839
Start Date
14 May 2020
End Date
14 March 2021
OCDE knowledge area(s)
Biotecnología relacionada con la salud
Keyword(s)
Investigación científica Proyectos Genomas Epidemiologia Enfermedades infecciosas Secuenciamiento Biología molecular
Resume
Implementar en tres laboratorios de Lima, un protocolo para amplificación de genoma SARS-CoV-2(30kb) a partir de ARN residual de muestras clinicas (para qPCR). Estandarizando el protocolo de secuenciamiento para la plataforma Illumina lo que permitira secuenciar, en paralelo, 50.100 genomas virales por corrida de secuenciamiento. Tambien se estandarizara el protocolo de secuenciamiento en la plataforma portatil Oxford Nanopore MinION. Permitiendo implementar el protocolo en laboratorios regionales sin acceso local a equipos Illumina. Se secuenciara 1,000 genomas virales lo que permitira identificar genotipos circulantes y establcer un mapa de transmision en Perú
Geographical scope of study or application of the project
PERÚ
Sources of information: Directorio de Proyectos Fondo Nacional de Desarrollo Científico, Tecnológico y de Innovación Tecnológica