Project name
Capacitación en técnicas genómicas y bioinformáticas de Campylobacter spp, la principal causa global de gastroenteritis bacteriana, en un centro líder de epidemiología molecular en el Reino Unido
Acronym
066-2019
Project code
066-2019
Status
Finished
Start Date
29 June 2019
End Date
29 September 2019
OCDE knowledge area(s)
Biotecnología relacionada con la salud
Keyword(s)
Movilizaciones Epidemiología Secuenciamiento Genoma Patógeno Bioinformáticas.
Resume
La pasantía propone visitar la La Universidad de Oxford, institución que tiene una gran trayectoria y prestigio en investigación, posicionándose en los primeros puestos de rankings internacionales. El Laboratorio Maiden pertenece a los grupos de investigación en Enfermedades Infecciosas del Departamento de Zoología desde 1998. El grupo liderado por el Profesor Martin CJ Maiden, cuenta con una línea de investigación específica en Campylobacter, que viene desarrollándose por 20 años con de 60 publicaciones sobre este organismo. La temática de su investigación se centra en la epidemiología molecular de Campylobacter en granjas de pollos broiler, y atribución de fuente de infección en infecciones humanas a través de datos de secuenciamiento de genoma completo (whole-genome sequencing, WGS) en Inglaterra. Su mayor contribución al estudio de la biología de este patógeno, es el desarrollo de un esquema de caracterización de “multilocus sequence typing” (MLST) específico para C. jejuni y C. coli, las dos principales especies causantes de gastroenteritis en humanos. Con el avance de nuevas técnicas genómicas, adaptaron este sistema de tipificación usando un abordaje de genoma completo a través de whole- genome MLST (wgMLST) y core genome MLST (cgMLST). Para almacenar y analizar las secuencias de los genomas bacterianos, desarrollaron el software open-source BIGSdb (Bacterial Isolate Genome Sequence database). El objetivo es la capacitación en técnicas genómicas y bioinformáticas de Campylobacter spp, la principal causa global de gastroenteritis bacteriana, en un centro líder de epidemiología molecular en el Reino
Institutional research line
Computación Paralela y Distribuida
Geographical scope of study or application of the project
REINO UNIDO
Sources of information: Directorio de Proyectos Fondo Nacional de Desarrollo Científico, Tecnológico y de Innovación Tecnológica