Project name
"Desarrollo de un modelo de predicción genómico para la evaluación de la respuesta inmune frente a patógenos basados en la ancestría, metagenómica y altitud geográfica del poblador mestizo y nativo de la región Huánuco"
Acronym
019-2019-FONDECYT-BM
Project code
019-2019-FONDECYT-BM
Status
Finished
Start Date
21 November 2019
End Date
20 July 2022
OCDE knowledge area(s)
Biotecnología relacionada con la salud
Keyword(s)
Investigación Científica Proyectos Genoma Metagenómica Modelo Predictivo Ancestría Inmunología Repositorio.
Resume
La función más importante del sistema inmune es controlar los patógenos tales como virus y bacterias que representan una amenaza en la homeostasis del ser humano. Los avances en genómica han permitido el acceso a la información del genoma humano y de diversos patógenos para identificar riesgo a desarrollar enfermedades y predecir apropiados tratamientos basados en estudios genómicos de poblaciones africanas y caucásicas, diferentes la población latinoamericana con alto componente nativo en su genoma (50% a 60%). El desarrollo de una enfermedad obedece a factores endógenos (variantes genéticas) como exógenos (microbiota y patógenos ambientales). El presente proyecto es una investigación interdisciplinaria que permitirá diseñar un método de predicción genómico para identificar qué individuos tendrán una mayor respuesta viral/inflamatoria basado en la respuesta inmunológica mediante el entendimiento de la genética del poblador, su microbiota y microbioma ambiental, los cuales podrán ser utilizados para un apropiado diagnóstico y tratamiento. Para tal fin, se incorporarán 4 investigadores a la Universidad de Huánuco (UDH) y se establecerá una colaboración entre coinvestigadores del Instituto Pasteur de Francia, Universidad de Harvard de EEUU y de la Universidad Pompeu Fabra de España. Se reclutarán 200 participantes entre nativos y mestizos que habitan o viven a diferentes niveles de altitud (300 a 4500 msnm) y distintas condiciones epidemiológicas de la región Huánuco. A cada participante se le hará una encuesta clínica (previa firma de consentimiento informado para participar y almacenar sus muestras en el estudio manteniendo el anonimato), se le tomará una muestra de sangre, una muestra de heces y un hisopado bucal y nasal para el estudio de la microbiota. El tipo de patógenos ambientales y sus patrones de resistencia serán estudiados de las aguas residuales. Se realizará el secuenciamiento genómico total y se estimulará sus células mononucleares con diferentes patógenos para identificar la relación entre respuesta inmunológica y su ancestría. La transferencia tecnológica (análisis experimentales y bioinformáticos) hacia la UDH será realizada desde los centros de investigación de nuestros coinvestigadores internacionales. Este proyecto permitirá además de la creación de un repositorio de muestras para futuros estudios e investigaciones colaborativas además de posicionar a la UDH en el área de genética-genómica y como centro de entrenamiento a nivel nacional
Institutional research line
Servicios ecosistémicos
Geographical scope of study or application of the project
PERÚ
Sources of information: Directorio de Proyectos Fondo Nacional de Desarrollo Científico, Tecnológico y de Innovación Tecnológica