Project name
Caracterización de SNPs en genes relacionados al crecimiento a partir de transcriptomas del lenguado Paralichthys adspersus
Acronym
CONV-000194-2015-FONDECYT-DE
Project code
CONV-000194-2015-FONDECYT-DE
Status
Finished
Start Date
14 January 2016
End Date
14 December 2019
OCDE knowledge area(s)
Biología marina, Biología de agua dulce, Limnología
Keyword(s)
Investigación Científica Proyectos RNA-Seq SNPs qPCR Crecimiento Acuicultura Lenguado
Resume
El desarrollo de un paquete tecnológico para el cultivo de P. adspersus en el Perú se encuentra limitado por factores intrínsecos y de manejo, sobre todo en estadios iniciales de su desarrollo, debido a procesos ontogénicos críticos (metamorfosis) que se evidencian en malformaciones, bajas tasas de crecimiento y altas tasas de mortalidad. Así, la evaluación de transcriptomas permitiría comprender cómo las condiciones de manejo afectan el crecimiento, desarrollo y nutrición, identificando las variaciones de la expresión de genes en función del tipo de tejido y las variantes abióticas, como se viene demostrando en otras especies de lenguados. Por lo que se viene trabajando en la identificación de polimorfismos de un solo nucleótido o SNPs asociados a un mayor crecimiento del lenguado P. adspersus, que sirva para el manejo de cultivos con selección asistida de genotipos; obtención de un panel de marcadores moleculares con potencial aplicación en el monitoreo del desarrollo y crecimiento de larvas y juveniles y la construcción de una base de datos de transcriptomas de larvas y juveniles de libre acceso al sector público y privado que pueda ser útil a investigadores de la institución y externos; en ese proceso se fortalecen también las capacidades de los profesionales de la institución. La identificación de SNPs asociados a un mayor crecimiento sirve para el manejo de cultivos con una selección asistida de genotipos, incrementando la rentabilidad de su producción El desarrollo del proyecto contempla el financiamiento de tres tesis: 2 de pregrado y 1 de postgrado, el resultado de estas investigaciones contribuyen a la ejecución del proyecto y posibilitan la realización profesional de sus autores, asimismo se tiene prevista la participación en eventos científicos con al menos 02 trabajos en congresos y/o simposios internacionales, la publicación de al menos 02 artículos en revistas indexadas y la capacitación en el manejo de herramientas bioinformáticas para el análisis de transcriptomas El proyecto también contribuye al fortalecimiento de las líneas de investigación a nivel institucional, con capacitación de los profesionales en estas técnicas de la nueva generación y la formación de jóvenes investigadores.
Institutional research line
Biología Molecular y Celular
Geographical scope of study or application of the project
PERÚ
Sources of information: Directorio de Proyectos Fondo Nacional de Desarrollo Científico, Tecnológico y de Innovación Tecnológica