Project name
“High-throughput methodologies and the application of genomic techniques for the study of mammalian evolution, with an emphasis on rodents” // "Metodologías de alto rendimiento y la aplicación de técnicas genómicas para el estudio de la evolución de los mamíferos, con énfasis en los roedores."
Acronym
312-2019
Project code
312-2019
Status
Finished
Start Date
30 October 2019
End Date
30 July 2020
OCDE knowledge area(s)
Zoología, Ornitología, Entomología, ciencias biológicas del comportamiento
Keyword(s)
Movilizaciones Adn Antiguo High-Throughput Methodologies Next Generation Sequencing.
Resume
La sistemática y taxonomía de los organismos tuvo como base fundamental el estudio de la morfologia, es asi que variaciones en la morfología era indicio de que se estaba lidiando con una especie potencialmente nueva. Con el descubrimiento del ADN, se entra en nueva etapa en la que se descubre que la morfología tanto estudiada ahora denominada fenotipo era causa por la expresión de determinados genes. Por lo tanto, cambios en la estructura del ADN de determinados genes producía la gran variedad morfológica que observamos hoy en día. Además, estos cambios en el ADN indican que son la fuente de la evolución de las especies, es por ello que en el siglo XX el estudio de la sistemática incorpora las secuencias de ADN para estudiar las relaciones filogenéticas entre las especies. Por lo tanto, todo el que quiera estudiar y tratar de entender esa fuerza que dirige la evolución, necesita investigar los cambios en la estructura genética. En la actualidad, las herramientas para la obtención del ADN han avanzado de manera gigantesca, lográndose amplificar en muchos casos el genoma completo de un organismo. Estos métodos son llamados Metodologías de alto rendimiento en las cuales se logra obtener cientos de genes de manera rápida y permite realizar análisis con mayor profundidad de los organismos. De igual forma se han implementado herramientas bioinformaticas que permitan usar esa gama de datos de manera eficiente y rápida. Siendo esta tecnología de gran importancia, esta pasantía tiene por objetivos 1) conocer y entender los fundamentos del trabajo con genomas, 2) creación de librerias de ADN para la amplificación de genomas de mamíferos (high-throughput sequencing library construction), 3) aprovechar estas herramientas para obtener ADN de muestras antiguas (muestras preservadas en museos con una antigüedad de casi un siglo) y 4) entrenamiento en análisis bioinformáticos para trabajar con base de datos grandes (large Dataset) ya que no se trabajará con un solo gen sino con miles de genes. Mi trabajo se centra en el estudio de roedores por ser organismos que cuentan un número significativo de muestras colectadas en la década de los 90 y muestras actuales , lo cual me permitirá observar los cambios geneticos de una población en un tiempo reciente. Por lo mismo, escogí como modelos roedores que ocurren en la Amazonia, área que ha sufrido grandes cambios por las actividades humanas como agricultura, ganadería, para analizar como estos cambios en el ambiente han repercutido en la diversidad genética de las especies.
Institutional research line
Genética y Bioquímica
Geographical scope of study or application of the project
ESTADOS UNIDOS
Sources of information: Directorio de Proyectos Fondo Nacional de Desarrollo Científico, Tecnológico y de Innovación Tecnológica