Los camélidos sudamericanos, principalmente las alpacas, constituyen un importante recurso ganadero en la mayoría de los productores del sur y centro del Perú, estos son esenciales para el sustento de miles de pequeños productores altoandinos, sin embargo esta se ve limitada por una serie de factores, como las enfermedades parasitarias, entre ellas la parasitosis gastrointestinales y coccidias. El proyecto tiene como objetivo determinar la variación genética e identificar marcadores moleculares asociados a la resistencia y susceptibilidad contra parásitos gastrointestinales y coccidias, y el desarrollo de un panel de marcadores con utilidad práctica. El trabajo se realizara en 2 lugares, el centro de crianza “Fundo Mallkini” que está a cargo de la empresa MICHELL y la estación experimental Quimsachata que está a cargo del Instituto Nacional de Innovación Agraria (INIA). Se realizara un recuento de los huevos de parásitos en heces y se clasificaran como resistentes (recuentos iguales a cero) o susceptibles (recuentos superiores a cero) a cada parásito y el método ELISA para identificar Sarcocistosis. Con la información se aplicara un modelo de regresión lineal mixto para la detección de regiones genómicas con la resistencia. Se tomaran muestras de sangre de animales de familias resistentes y susceptibles para secuenciar los genomas mediante la metodología ddRADSeq y realizar la búsqueda de marcadores tipo SNP Y asociarlos a la resistencia a la resistencia. Se espera tener información de la variabilidad genética para la resistencia o susceptibilidad a enfermedades parasitarias. También se espera encontrar marcadores moleculares asociados a la resistencia o susceptibilidad a las PGC y desarrollar un panel de marcadores con potencial uso en los programas de mejoramiento genético mediante la selección asistida por marcadores, pudiendo aumentar la frecuencia de animales resistentes y ser utilizada como herramienta complementaria en programas de control de parásitos.