La neumonía permanece como una las principales causas de muerte a nivel mundial. Representa más de dos millones de muertes al año a nivel mundial (OMS). Las neumonías severas son causadas por infecciones bacterianas, siendo el neumococo el patógeno más común. El neumococo es responsable de aproximadamente 800 000 muertes anuales en niños menores de 5 años. Gran parte de esta problemática se debe a terapias antibióticas poco efectivas, la cual se explica por la aparición de resistencia antibiótica de este patógeno. Si bien existen métodos para la detección de resistencia antimicrobiana basados en cultivos, este procedimiento no observa la totalidad de genes de resistencia presentes en la muestra de nasofaringe. Además, este método no toma en cuenta bacterias comensales o potencialmente patógenas, por lo que la detección de resistencia antibiótica es muy sesgada. Además, existen especies bacterianas que no pueden ser cultivadas, por lo que la resistencia antibiótica encontrada en un método de cultivo es muy limitada. Los genes de resistencia en bacterias colonizantes, no patógenas, pueden ser transferidos a cepas patógenas. Hasta la fecha no se ha realizado a nivel local un estudio de descripción de resistomas nasofaríngeo dado que no se cuenta con un equipo de secuenciamiento costo-efectivo para tal fin. CARGMiG cuenta con experiencia en la investigación de resistencia antibiótica y equipos capaces de realizar estudios de resistomas. El Dr.Hanson lidera el laboratorio descrito y cuenta con experiencia en investigación de resistomas en muestras nasofaríngeas.