La Amazonía peruana es parte del centro de diversidad de Theobroma cacao. El ICT/ INCAGRO/USDA/ARS realizó expediciones para colectar cacao silvestre en la cuencas de los ríos Marañon , Aypena, Ungurahui, Ungumayo, Nucuray, Urituyacu, Chambira, Tigre, Napo, Santiago, Morona, Ucayali, Urubamba, Madre de Dios, Putumayo y Yavari. La sostenibilidad del cacao a nivel nacional se ve amenazada por el incremento de plantaciones monoclonales con el clon CCN51. El cacao es una especie muy poco trabajada geneticamente en el Perú. Se colectaron 560 accesiones de cacao silvestre y se conservan en el Banco de Germoplasma del ICT- Tarapoto, este nuevo material de diversificación del cacao en el Perú, aun no ha sido caracterizado a nivel morfológico, molecular y la química de la cascara del fruto y su relación con el rendimiento y de grano y pectina usados ampliamente para la producción de chocolates y como espesantes en repostería y artículos de cosmetología y aseo personal, respectivamente, potencialmente debemos conocer los mejores genotipos que producen insumos para la producción de jabones por ejemplo, ampliamente usados en las políticas para hacer frente al COVID-19, el conocimiento de estas características son importantes para el establecimiento de plantaciones comerciales y sostenibles de calidad de manera rápida o que se incluyan en los programas de mejoramiento. El proyecto pretende dilucidar estos aspectos para ayudar a solucionar esta situación, mediante la selección de cacao de silvestres con superior rendimiento, de grano y pectina. Esta selección aplicara metodologías para caracterizar genotipos en base a descriptores morfológicos y moleculares, así como de sus contenidos de pectina en la cascara de los frutos. Se pretende seleccionar al menos 10 genotipos con mayores rendimientos productivos, con granos de calidad, y con mayor producción de pectina como insumo en la industria culinaria y farmacéutica. Su posterior denominación, en base a los resultados obtenidos hace posible incrementar la productividad y calidad del cacao en la región Loreto, San Martín y el Perú en su conjunto