Project name
Análisis genómico comparativo para la identificación de los genes homólogos de las rutas fotosintéticas en Solanáceas
Acronym
SUB-TESIS-UNALM-2022-001-004-FC
Project code
112003945
Status
Active
Start Date
22 September 2022
OCDE knowledge area(s)
Otros temas de Biología
OCDE activity
Investigación básica
Keyword(s)
Diversidad genética proteoma A. thaliana Capsicum annuum Nicotiana attenuata Nicotiana sylvestris Nicotiana tabacum Nicotiana tomentosa Solanum lycopersicum Solanum pennellii Solanum tuberosum
Resume
El proceso biológico más sostenible del planeta es la fotosíntesis pues su mecanismo permite aprovechar la energía solar, agua y CO2 para producir energía química y fotosintatos que son de relevancia para el metabolismo primario y secundario en diferentes organismos. Este mecanismo ha sido ampliamente estudiado a nivel fisiológico, bioquímico y de genómica funcional. No obstante, es necesario elucidar los mecanismos genéticos de la regulación fotosintética vegetal en áreas de alta diversidad genética que se encuentran amenazadas por el cambio climático. Es el caso de las solanáceas, una familia que abarca más de 3000 especies distribuidas en países megadiversos como Perú, Ecuador y Bolivia, con la finalidad de preservar la biodiversidad y garantizar la seguridad alimentaria. Así, el objetivo de esta tesis fue realizar un análisis genómico comparativo entre los genes involucrados en 8 rutas fotosintéticas de Capsicum annuum, Nicotiana attenuata, Nicotiana sylvestris, Nicotiana tabacum, Nicotiana tomentosa, Solanum lycopersicum, Solanum pennellii y Solanum tuberosum; tomando como referencia el proteoma A. thaliana. En tal sentido, se logró identificar 136 genes homólogos de A. thaliana en las 8 solanáceas estudiadas y 24 genes que no presentaron homología. Además, se obtuvieron 99 secuencias ortólogas únicas y en función a su relevancia en el proceso fotosintético se seleccionó a LPE1, HCF173, CRR23, NDH48, ATPC, RuBisCO, GAPB y TPI para realizar un análisis filogenético y de motivos. Los únicos genes que presentaron coherencia taxonómica fueron LPE1, HCF173, CRR23, NDH48 y ATPC. Por otro lado, al análisis de motivos reveló una alta conservación de los genes. Estos hallazgos son fundamentales para comprender la evolución del aparato fotosintético en solanáceas y su mecanismo de adaptación a los efectos adversos del cambio climático.
Institutional research line
Biotecnología [Línea de investigación]
Geographical scope of study or application of the project
La Molina, Lima
-12.0789
-76.9169
Sources of information: Directorio de Proyectos Universidad Nacional Agraria La Molina