Las crías de ovejas locales sudamericanas (Criollas), derivan de dos principales razas españolas (Merino y Churra), cuya introducción a las Américas tuvo lugar con los viajes de Colon a finales del siglo XV, y más tarde mediante las importación de otras razas desde mediados del siglo XIX. Los animales que ingresaron al continente americano se encontraron bajo una fuerte presión selectiva para adaptarse al nuevo ambiente, enfrentando nuevas enfermedades, climas extremos y fuentes de alimentos propios de las Américas. Actualmente, la población peruana de ovejas presenta más de 15 millones de animales (> 60% de la raza criolla local), produce aproximadamente 31 toneladas de carne y 13 toneladas de lana, generando un ingreso fijo para más de 1.25 millones de familias de bajos ingresos. A pesar de su importancia, su diversidad genética permanece en gran parte sin estudiar y actualmente no existen programas nacionales para el mejoramiento genético de las razas locales. Este proyecto recogerá muestras de ovejas de ambientes extremos en zonas de gran altura (Puna húmeda y seca> 3,700msnm) y bajas alturas (costa seca y bosque <1,000msnm) para la genotipificación con arreglos de SNP 50K para ovinos de Illumina (> 50 mil marcadores). Estos datos se compararán con un panel de razas europeas, incluidos los antepasados españoles putativos, para aclarar los orígenes y el estado actual de las poblaciones peruanas. La comparación entre las poblaciones europeas y peruanas utilizando pruebas para la detección de señales de selección permitirá la identificación de los genes implicados en su rápida adaptación al Nuevo Mundo. Por último, una comparación entre las poblaciones peruanas en entornos contrastantes permitirá la identificación de los genes implicados en la adaptación a entornos de gran altura y ambientes secos. Los resultados facilitarán el desarrollo de estrategias de reproducción asistida para aumentar la resiliencia al cambio climático y mejorar la producción en una de las especies de ganado más importantes de Perú.