Project name
̈Análisis de datos de secuenciamiento de ARN total (RNA-seq) aplicado a investigación en Tuberculosis ̈
Acronym
025-2018
Project code
025-2018
Status
Finished
Start Date
01 October 2018
End Date
01 January 2019
OCDE knowledge area(s)
Enfermedades infecciosas
Keyword(s)
Movilizaciones Tuberculosis Exosomas Transcriptómica Bioinformática.
Resume
Los análisis de base de datos requieren del uso de programas de Bioinformática y una infraestructura adecuada basada en servidores y computadoras con alta capacidad de almacenamiento. En el caso de la tuberculosis, los trabajos de investigación básica están orientados a identificar regiones especificas de la bacteria, sin embargo los trabajos más recientes se han enfocado en la búsqueda de biomarcadores diferenciales entre personas sanas y personas con diagnóstico de tuberculosis activa basados en la expresión de diversos ARNs del hospedero. Estas moléculas pequeñas varían durante la infección y son potenciales candidatos para diagnóstico y futuras vacunas. En este contexto es necesario secuenciar el ARN total presente en los grupos mencionados y posteriormente realizar el análisis bioinformático que nos ayudará a identificar la expresión de ARNs en sanos y enfermos con significancia estadística y posteriormente validar estas pequeñas moléculas en una población mayor con las características de control y pacientes. Es por esta razón que se considera necesario aprender a manejar los programas bioinformáticos a partir de corridas de secuenciamiento total de ARN y entender los resultados obtenidos para futuras aplicaciones en el diagnóstico de la enfermedad.
Institutional research line
Físco-química
Geographical scope of study or application of the project
CHILE
Sources of information: Directorio de Proyectos Fondo Nacional de Desarrollo Científico, Tecnológico y de Innovación Tecnológica