Project name
Identificación molecular de ADN de la diversidad ictiológica de los ambientes marinos, de manglar y continental del departamento de Tumbes
Acronym
CONV-000192-2015-FONDECYT-DE
Project code
CONV-000192-2015-FONDECYT-DE
Status
Finished
Start Date
22 January 2016
End Date
22 July 2019
OCDE knowledge area(s)
Genética, Herencia
Keyword(s)
Investigación Científica Proyectos DNA barcode Biodiversidad molecular Manglares Tumbes Ictiología Peces
Resume
El conocimiento acerca de la diversidad biológica es el punto de partida para todos los estudios básicos o aplicados relacionados a las ciencias de la vida. Dentro de esta diversidad los peces representan el mayor grupo de vertebrados acuáticos. En el Perú se han reportado más de 1039 especies de peces, dentro de ellos aproximadamente 300 especies han sido reportadas en la región Tumbes. La elevada diversidad de esta región es debida a la suma de diferentes factores ambientales tales como los ecosistemas existentes (costero, arrecifes rocoso, manglar, continental), la corriente de El Niño y al evento del mismo nombre. Adicionalmente el ecosistema de manglar, propio de esta región, constituye zonas de cría “cuna” para peces, el cual alberga especies endémicas. Considerando la eficacia y la utilidad de la metodología del código de barras de ADN en la identificación molecular y la separación de especies, la amplia variedad de peces de la región Tumbes, el impacto ambiental antrópico que los ambientes acuáticos de la región vienen enfrentando debido al cultivo acuícola, agrícola, entre otros y la falta de datos moleculares, hacen que sea necesario y obligatorio dar inicio a investigaciones relacionadas a la identificación molecular de la ictiofauna. Ante lo expuesto este proyecto tiene como objetivo principal realizar el levantamiento de la diversidad ictiológica de la región Tumbes, el cual incluye ambiente marino, de manglar y continental, aplicando la metodología del código de barras de ADN con lo cual se ayudaría a confirmar la presencia de las especies existentes, reportar nuevas ocurrencias así como identificar posibles nuevas especies, fortaleciendo una nueva área de investigación en esta región. Para llevar a cabo este proyecto, se viene colectando cinco individuos de cada especie a lo largo de toda la región Tumbes, los cuales son identificados morfológicamente, fotografiados, codificados y almacenados en la colección del Laboratorio Costero de Tumbes, posteriormente se viene extrayendo 1 cm3 de tejido para la extracción del ADN, la cual viene siendo realizada empleando kits comerciales. El gen Citocromo oxidasa subunidad I de 650 pares de bases viene siendo amplificado mediante la técnica de PCR, empleando diferentes conjuntos de primers universales, el secuenciamiento está siendo conducido mediante la metodología de Sanger. Para el alineamiento y edición de las secuencias, así como para la elaboración de los cladogramas diferentes programas bioinformáticos vienen siendo utilizados tales como el Geneious, Bioedit, Clustal W, Muscle y Mega. Se esta considerando las recomendaciones del BOLD aplicando el método evolutivo de “Neighbor joining” y modelo de sustitución de Kimura 2- parámetros. Hasta la fecha (01 de Febrero del 2017) se tiene amplificado y secuenciado el 30% de las especies propuestas. A través de este proyecto se viene capacitando en el campo de la genética molecular y biodiversidad a tres jóvenes investigadores peruanos (pregrado, maestría y doctorado) los cuales vienen desarrollando sus tesis en esta área, apoyándolos y motivándolos de esta manera a ingresar al mundo de la investigación científica. Finalmente este proyecto ayudaría a evitar el fraude a los consumidores, toda vez que se aseguraría que el recurso a consumir corresponde a la especie descrita científicamente.
Institutional research line
Biología Molecular y Celular
Geographical scope of study or application of the project
PERÚ
Sources of information: Directorio de Proyectos Fondo Nacional de Desarrollo Científico, Tecnológico y de Innovación Tecnológica