Las aves silvestres son reconocidas como portadores de una diversa gama de agentes zoonóticos bacterianos, parasitarios y virales, así como de agentes perjudiciales para la producción avícola nacional. Diversos estudios han demostrado que muertes masivas de aves marinas son ocasionadas por patógenos introducidos por aves migratorias. Así mismo, múltiples reportes muestran que el contacto de aves silvestres con domésticas ha ocasionado brotes de enfermedades con pérdidas importantes en la industria avícola. Por otro lado, el contacto directo o indirecto con los seres humanos representa un riesgo de enfermedades al introducir agentes potenciales emergentes zoonóticos en poblaciones susceptibles. El presente estudio tiene por objetivo la detección y caracterización molecular de los principales patógenos presentes en aves silvestres en el territorio peruano. Para ello, la presente propuesta abarca el análisis de los virus de la influenza A, de la enfermedad de Newcastle, de la Fiebre del Oeste del Nilo; las bacterias Salmonella spp, Pasteurella multocida, Chlamydophila psittaci, Campylobacter yeyuni; y el hongo Cryptococcus neoformans. Se tomarán muestras de heces e hisopados traqueales y cloacales en diversas especies aviares silvestres como son las acuáticas residentes y migratorias, así como las urbanas y suburbanas del orden columbiforme (palomas) y paseriforme (gorriones), las cuales serán analizadas, en el caso de bacterias y hongos, mediante cultivo microbiológico, y en el caso de agentes virales, mediante aislamiento viral en huevos embrionados SPF. La identificación y caracterización de las cepas aisladas se llevará a cabo mediante la técnica de PCR para lo cual se utilizarán cebadores específicos para cada agente patógeno. Como resultado se espera la detección de los agentes mencionados determinando su frecuencia por agente, por ubicación geográfica, tipo de hábitat y tipo de ave. Se busca aportar información básica sobre los patógenos circulantes presentes en las aves silvestres de nuestro medio, de importancia para la salud pública, la salud avícola, y la conservación de la avifauna, contribuyendo con el incipiente desarrollo de las investigaciones en esta línea en el país, lo que permitirá elaborar y mejorar metodologías de prevención y control de enfermedades zoonóticas en humanos y enfermedades emergentes y prevalentes en aves silvestres y domésticas, estas últimas como principal alimento de la población humana en el Perú.