Los bosques de Polylepis están considerado en peligro de extinción; el Decreto Supremo N°043- 2006-AG reporta a 14 de las 28 especies conocidas, además de ser uno de los ecosistemas más amenazados del mundo según el PNUMA; ello debido a que estos bosques han sido deforestados históricamente para ser usados como fuente energética en la Colonia para centros mineros, y en la actualidad vienen siendo deforestados para extender zonas de pastoreo y agricultura, lo cual afecta substancialmente la estructura del suelo, disminuyendo su capacidad de protección y regeneración, así como a la flora y fauna que se alberga dentro de estos bosques, alterando el equilibrio dinámico de estos ecosistemas de montaña. El proyecto busca determinar las características citogenéticas, y moleculares relacionado a la diversidad de los bosques del género Polylepis de la Región Junín, empleando marcadores SSR. El proyecto se realizará en 3 etapas, las cuales son: 1) Colecta y establecimiento de un banco de germoplasma del género Polylepis originarias de la región Junín, 2)Caracterización molecular de las accesiones, 3) Caracterización citogenética y ecológica de las accesiones. Se espera obtener un perfil de la diversidad genética, estructura poblacional y características citogenéticas y ecológicas de los bosques de Polylepis de las zonas de estudio, que permita realizar un análisis que con conlleve a mejorar e implementar planes de conservación y/o recuperación de éstos ecosistemas de montaña. A la vez contribuir y fortalecer las capacidades científicas en cuanto al uso de este tipo de tecnologías orientado al estudio genético y ecológico de especies endémicas del Perú. El conocimiento generado permitirá la implementación de programas de conservación del género Polylepis, que mejoren el aprovechamiento del mismo, de forma sostenible, así como el fortalecimiento de la identidad histórica-cultural-natural como producto de las relaciones sociales en el esfuerzo comunal de conservación, a partir de las utilidades agrícolas, ganaderas, medicinales y ecológicas del Polylepis, y finalmente mantener y mejorar los servicios ambientales que brindan los bosques, que tendrían repercusión directa en la calidad de vida las comunidades Alto Andinas y las poblaciones ubicadas en las partes bajas de las cuencas. A mediano y largo plazo, establecer programas de reforestación, que con un manejo adecuado ayudarían a mitigar la erosión de suelos, regular el ciclo hídrico, mitigar el cambio climático y basado en las amplias extensiones que puede cubrir este género en Los Andes se contribuiría a la captura de carbono, conservación de flora y fauna relacionados exclusivamente a estos bosques, entre otros.