Project name
Caracterización Filogenómica, detección genética de virulencia y resistencia antimicrobiana de Escherichia coli causantes de brotes entéricos y enfermedad de los Edemas en cerdos de Granjas de Lima
Acronym
413-2019
Project code
413-2019
Status
Active
Start Date
19 December 2019
End Date
18 September 2022
OCDE knowledge area(s)
Ciencia veterinaria
Keyword(s)
Investigación Científica Proyectos Escherichia coli Resistencia bacteriana FIlogenética
Resume
Escherichia coli, es una bacteria comensal y parte de la microbiota intestinal del hombre y animales. Sin embargo, la adquisición de genes de virulencia y resistencia a los antibióticos producen infecciones intestinales y sistémicas con difícil éxito terapéutico. En la producción porcina mundial y en nuestro país, Escherichia coli disminuye la productividad produciendo altas tasas de morbilidad y mortalidad, especialmente en animales jóvenes y conforman una de las principales Enfermedades de transmisión alimentaria (ETA). Por ello, el presente proyecto tiene como objetivo la determinación de genes de virulencia, de resistencia a los antibióticos en aislados de Escherichia coli de porcinos, y posteriormente analizar el origen y su relación filogenética con cepas reportadas en otras especies y en casos clínicos de humanos. Para ello, se utilizarán más de los 125 aislados de E coli obtenidos de diferentes granjas porcinas de lima a partir de casos de diarreas y enfermedad de los edemas. Mediante PCR múltiple se determinaran los genes de virulencia (eae, bfp, Lt, Stx1, Stx2, sta, stab y lt y F4, F5, F6, F17, F41) y los genes de resistencia los principales grupos de antibióticos y de mayor importancia en la industria porcina: tetraciclinas (tetA, tetB, and tetC), sulfonamidas (sul1, sul2, and sul3), streptomicina-spectinomicina (strA/strB, aadA), y apramicina (aac(3)IV), para finalmente secuenciar el genoma completo de 05 cepas Multidrogoresistente usando la plataforma Illumina, Los genes de resistencia y sus contextos (elementos móbiles) se detectarán utilizando el anotador de resistencia a múltiples antibióticos (MARA) y se obtendrá un árbol filogenético. Los resultados permitirán reconocer los patotipos circulantes y sus características que permitirán establecer estrategias preventivas y de control, como protocolos terapéuticos y vacunas específicas que permitan reducir la incidencia y diseminación de la enfermeda, y aporta información importante para la salud pública en la lucha contra la Resistencia bacteriana a los antibióticos.
Institutional research line
Procesamiento
Geographical scope of study or application of the project
PERÚ
Sources of information: Directorio de Proyectos Fondo Nacional de Desarrollo Científico, Tecnológico y de Innovación Tecnológica