La acuicultura moderna provee de medios efectivos para la producción intensiva de organismos acuáticos bajo condiciones controladas. Tal industria crece rápidamente, generando problemas severos de enfermedades. El uso rutinario de antibióticos no es aconsejable ya que aumenta el riesgo de promover la resistencia al antibiótico e influir adversamente en la microflora autóctona, al medio ambiente y salud humana. Por lo cual, el desarrollo de estrategias alternativas en el control de las enfermedades es urgente. Asimismo, las expectativas futuras de utilizar bacterias marinas en la sanidad acuícola han conducido a buscar alternativas en el desarrollo de técnicas preventivas y terapéuticas para reducir o impedir patologías. Más de 5000 antibióticos que se encuentran en el mercado derivan únicamente de microorganismos, siendo los actinomicetos mayores productores de compuestos antimicrobianos. La estructura química de estas biomoléculas presenta una gran diversidad molecular y especificidad bioquímica. Los aislamientos de microorganismos productores de novedosos compuestos biactivos, realizados en países megadiversos ubicados en el trópico representan el 20-30% del total. Debido a que el Perú posee una alta diversidad, el estudio de la diversidad microbiana, en particular, del grupo de los actinomicetos podría ofrecer una gran posibilidad de encontrar microorganismos productores de compuestos antimicrobianos con nuevas estructuras químicas.