Los efluentes de la industria textil son una de las principales fuentes de contaminación ambiental porque la mayoría contienen colorantes azoicos difíciles de eliminar por tratamientos convencionales. Los colorantes azoicos son compuestos xenobióticos electrofílicos resistentes a la degradación y comúnmente liberados al ambiente. Además, pueden ser carcinogénicos y mutagénicos. La incorrecta eliminación de estos efluentes genera efectos tóxicos sobre la flora y fauna acuática. Una alternativa para tratar estos efluentes con colorantes es el uso de microorganismos con capacidad de degradarlos. Se han reportado varias especies bacterianas y hongos, pero no en nuestro país. En este sentido, el presente estudio está orientado a caracterizar el genoma completo y el transcriptoma de aislados de Shewanella sp., bacteria nativa aislada de un efluente de una fàbrica textil de la ciudad de Lima. Se extraerá el DNA genómico y el RNA del aislado con mayor capacidad biodegradadora, se enviará a secuenciar a la empresa Macrogen Inc. Korea y con las secuencias obtenidas se hará el ensamblaje de novo, la anotación del genoma y se determinará los niveles de expresión de genes (RNA-seq), usando herramientas bioinformáticas. La información permitirá generar conocimientos sobre las rutas metabólicas y los genes involucrados en la biodegradación de colorantes azo, para su futura aplicación en biorremediación de ambientes contaminados.